Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HAPLN4Q86UW8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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