Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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TRAPPC6BQ86SZ2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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TRAPPC6BQ86SZ2 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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TRAPPC6BQ86SZ2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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