Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms