Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP31Q70CQ4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms