Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms