Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDF6Q6KF10 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms