Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
STRIP1Q5VSL9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms