Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF2Q5BJF6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms