Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms