Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXD4L6Q3SYB3 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms