Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EDRF1Q3B7T1 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms