Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CA9Q16790 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA9Q16790 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA9Q16790 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms