Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB1Q16531 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC19■□□□□ 0.63
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DDB1Q16531 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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