Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CNGA3Q16281 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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