Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms