Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SMCO1Q147U7 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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