Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NBR1Q14596 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NBR1Q14596 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms