Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COL4A6Q14031 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms