Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms