Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4AQ13619 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms