Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CUL3Q13618 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CUL3Q13618 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CUL3Q13618 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL3Q13618 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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