Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HDAC1Q13547 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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