Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PMS2P3Q13401 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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