Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRSF5Q13243 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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