Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HSPB3Q12988 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HSPB3Q12988 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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