Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TWF1Q12792 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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TWF1Q12792 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TWF1Q12792 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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