Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
REG3AQ06141 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms