Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC026117.1-201ENST00000509658 883 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ARL1-203ENST00000539055 1231 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LINC00662-207ENST00000590677 883 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC026333.4-201ENST00000613543 544 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC079336.6-201ENST00000624836 613 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RNU4-86P-201ENST00000410135 219 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC013469.1-201ENST00000426985 403 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 PDE4D-209ENST00000502575 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 HEXB-205ENST00000509579 806 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TNP2Q05952 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms