Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SPIBQ01892 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms