Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42EP1Q00587 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms