Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTSOP43234 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTSOP43234 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSOP43234 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSOP43234 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSOP43234 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSOP43234 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSOP43234 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSOP43234 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSOP43234 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSOP43234 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSOP43234 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSOP43234 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSOP43234 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSOP43234 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSOP43234 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms