Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC1A1P43005 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms