Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD13P35453 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms