Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
BMI1P35226 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BMI1P35226 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms