Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
BCKDHBP21953 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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