Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DESP17661 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DESP17661 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DESP17661 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms