Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GJA1P17302 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms