Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPCAMP16422 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms