Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD8P13378 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXD8P13378 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms