Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ACTN1P12814 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms