Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C4BP0C0L5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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