Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC9O60706 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCC9O60706 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms