Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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CLDN25C9JDP6 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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