Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVV-1B6SEH8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVV-1B6SEH8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms