Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC78A2IDD5 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC78A2IDD5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms