Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF3Q9ULD4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms