Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KLHL42Q9P2K6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms