Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HACD3Q9P035 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms