Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GDE1Q9NZC3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GDE1Q9NZC3 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GDE1Q9NZC3 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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GDE1Q9NZC3 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDE1Q9NZC3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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