Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SNX15Q9NRS6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SNX15Q9NRS6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SNX15Q9NRS6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SNX15Q9NRS6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SNX15Q9NRS6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SNX15Q9NRS6 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SNX15Q9NRS6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX15Q9NRS6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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